ОАО «МНИПИ» уделяет огромное внимание качеству продукции. Для этого в организации разработана и внедрена эффективная система менеджмента качества (СМК), которая соответствует требованиям международного стандарта ISO 9001.
В настоящий момент в ОАО «МНИПИ» действует последняя версия СТБ ISO 9001-2015.
В 2024 году Органом по сертификации СМК был выдан сертификат соответствия № BY/112 05.01.003.01 00992 со сроком действия до 8 января 2027 года, удостоверяющий, что СМК разработки, производства и ремонта радиоэлектронной продукции, приборов и средств измерений соответствует требованиям стандарта.